選舉結果對政府財經面也有影響。首當其衝的是中央和地方財政收支問題，至於對股市等信心面的打擊，經建會認為應該是短期的。
在行政院蕭院長領軍下，歷任經建會主委以及孫資政為經建會二十週年暨新大樓落成剪綵並合影留念。然而所有出席的財經內閣閣員，卻因為選舉結果不理想而臉色凝重。
蕭院長的招牌微笑不見了，對內閣改組不願多談。
財政部長邱正雄更是直接要面對在野黨縣市長向中央要求經費的窘境。目前只能靠“財政收支劃分法“盡快修法完成。
而經建會主委江丙坤的看法還算樂觀，他認為選舉結果對總體經濟的影響應該是暫時性的。
他也強調，政府不會因地方首長的變化，影響既定政策執行。雖然各縣市長有不同施政風格，但畢竟還是須依法行事。 不過，對於舉著“財經內閣“大旗的蕭內閣來說，這次選舉對今後財經政策的推動，勢必將有所影響。拜耳投資案如今又要訴諸公民投票，恐怕只是讓蕭院長煩惱的開端而已。
新聞來源：華視新聞
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